Dans l'épisode 3x11, on apprend qu'il y a 8 ans, il a vu sa mère mourir à l'hôpital alors que son père était ailleurs.
Toujours dans cet épisode, il va mourir temporairement pour pouvoir sauver son père, enlevé par le Darach. Cependant, il devra en payer le prix.
Dès l'épisode 3x13, Stiles fait des cauchemars et a du mal à s'en remettre. Il sauve toutefois Malia Tate toutefois avec Scott, Allison, Lydia et Isaac.
Alors qu'il pense s'en remettre, on découvre que Stiles est possédé par l'esprit d'un renard maléfique, le nogitsune.
Dès lors, le nogitsune le pousse à faire diverses choses dangereuses (blesser ses amis, poser des bombes, ...). Lorsque Stiles a le contrôle de son corps, il essaye de découvrir comment vaincre le nogistune. Il découvre l'histoire du renard et des indices s'y rapportant.
Dans l'épisode 3x20, Stiles (le vrai) s'enferme volontairement dans un asile pour ne plus blesser ses amis et revoit Malia Tate, le coyote garou. Il se rapproche d'elle intimement mais lorsqu'elle est danger, il n'a d'autre choix que de laisser le nogitsune reprendre le contrôle pour ne plus qu'elle soit attaquée.
Dans l'épisode 3x22, "Bad Stiles" prend le contrôle de certains personnages de la série et les poussent à se battre les uns contre les autres. Pour arrêter ce massacre, Scott s'infiltre dans son esprit avec Lydia et parvient à libérer Stiles de l'emprise qu'exerçait le nogitsune. Désormais il y a 2 Stiles : le bon et le mauvais, dans 2 corps.
Dans le 3x23, l'état de Stiles s'aggrave alors que Bad Stiles prend le contrôle des Onis, provoquant la mort d'Allison.
Dans le 3x24, Bad Stiles pousse Scott à tuer Stiles mais ce dernier fait appel au coup de maître (référence de la série au jeu asiatique "GO"), l'anéantissant avec l'aide de ses amis.
